कोपासि

अंग्रेजी जून 2026 COPASI 2004 10 11 4.40 (Build 278) 2023 05 31 C++ Linux, macOS and Microsoft Windows Qt Artistic License http://www.copasi.org copasi.orgCOPASI (कॉम्प्लेक्स पाथवे सिम्युलेटर) एक ओपन-सोर्स सॉफ्टवेयर एप्लिकेशन है जो जैविक प्रक्रियाओं के गणितीय मॉडल जैसे चयापचय नेटवर्क, सेल-सिग्नलिंग पाथवे, नियामक नेटवर्क, संक्रामक रोगों और कई अन्य को बनाने और हल करने के लिए है।Hoops S. Sahle S. Gauges R. Lee C. Pahle J. Simus N. Singhal M. Xu L. Mendes P. 2006 COPASI--a COmplex PAthway SImulator https://archive.org/details/sim_bioinformatics_2006-12-15_22_24/page/3067 Bioinformatics 22 24 3067–3074 10.1093/bioinformatics/btl485 17032683 free इतिहास. COPASI गेपासी सिमुलेशन सॉफ्टवेयर पर आधारित है जिसे 1990 के दशक की शुरुआत में पेड्रो मेंडेस द्वारा विकसित किया गया था।Mendes P. 1993 GEPASI: A software package for modelling the dynamics, steady states and control of biochemical and other systems https://archive.org/details/sim_bioinformatics_1993-10_9_5/page/563 Computer Applications in the Biosciences 9 5 563–571 10.1093/bioinformatics/9.5.563 8293329 free कोपासी के प्रारंभिक विकास को वर्जीनिया जैव सूचना विज्ञान संस्थान और क्लाउस त्स्चिरा फाउंडेशन द्वारा वित्त पोषित किया गया था। वर्तमान विकास प्रयासों को राष्ट्रीय स्वास्थ्य संस्थान, बीबीएसआरसी और जर्मन शिक्षा मंत्रालय से अनुदान द्वारा समर्थित किया जाता है। विकास दल COPASI मैनचेस्टर विश्वविद्यालय (यूके), हीडलबर्ग विश्वविद्यालय (जर्मनी) और वर्जीनिया जैव सूचना विज्ञान संस्थान (यूएसए) के बीच एक अंतरराष्ट्रीय सहयोग का परिणाम है। परियोजना के प्रमुख जांचकर्ता पेड्रो मेंडेस और उर्सुला कुम्मर हैं। मुख्य सॉफ्टवेयर वास्तुकार स्टीफन हूप्स और स्वेन साहले हैं। फीचर्स सी. ओ. पी. ए. एस. आई. में जैविक प्रक्रियाओं के मॉडल को परिभाषित करने, इन मॉडल का अनुकरण और विश्लेषण करने, विश्लेषण रिपोर्ट उत्पन्न करने और एस. बी. एम. एल. प्रारूप में आयात/निर्यात मॉडल शामिल हैं। मॉडल परिभाषा मॉडल को आणविक प्रजातियों के बीच रासायनिक प्रतिक्रियाओं के रूप में परिभाषित किया जाता है। मॉडल की गतिशीलता व्यक्तिगत प्रतिक्रियाओं से जुड़े दर कानून द्वारा निर्धारित की जाती है। मॉडल में डिब्बे, घटनाएँ और अन्य वैश्विक चर भी शामिल हो सकते हैं जो प्रणाली की गतिशीलता को निर्दिष्ट करने में मदद कर सकते हैं। कार्य कार्य विभिन्न प्रकार के विश्लेषण हैं जिन्हें एक मॉडल पर किया जा सकता है। इनमें स्थिर-अवस्था विश्लेषण, स्टोइकिओमेट्रिक विश्लेषण, नियतात्मक और यादृच्छिक अनुकरण एल्गोरिदम का उपयोग करके समय पाठ्यक्रम अनुकरण, चयापचय नियंत्रण विश्लेषण, ल्यपुनोव प्रतिपादक की गणना, समय पैमाने का पृथक्करण, पैरामीटर स्कैन, अनुकूलन और पैरामीटर आकलन शामिल हैं। आयात और निर्यात COPASI मॉडल को SBML प्रारूप के साथ-साथ गेपासी प्रारूप में भी पढ़ सकता है। COPASI कई अलग-अलग प्रारूपों में मॉडल लिख सकता है, जिसमें SBML, C प्रोग्रामिंग भाषा में स्रोत कोड, Berkeley Madonna files, और XPPAUT https://web.archive.org/web/20220418210023/http://www.math.pitt.edu/~bard/xpp/xpp.html 18 April 2022 18 April 2022 शामिल हैं। यह भी देखें सिस्टम बायोलॉजी मॉडलिंग सॉफ्टवेयर की सूची संदर्भ हूप्स, एस.; साहले, एस.; गॉजेस, आर.; ली, सी.; पाहले, जे.; सिमस, एन.; सिंघल, एम.; ज़ू, एल.; मेंडेस, पी.; कुम्मर, यू. (2006). “COPASI — एक जटिल मार्ग सिम्युलेटर”. बायोइन्फॉर्मेटिक्स. 22 (24): 3067–3074। मेंडेस, पी. (1993). “GEPASI: जैवरासायनिक तथा अन्य प्रणालियों की गतिकी, स्थिर अवस्थाओं और नियंत्रण के मॉडलिंग हेतु एक सॉफ़्टवेयर पैकेज”. कंप्यूटर एप्लिकेशन्स इन द बायोसाइंसेज़. 9 (5): 563–571। बाहरी लिंक COPASI होम पेज मेंडेस समूह, जैविक प्रक्रियाओं का मॉडलिंग विभाग, हीडलबर्ग विश्वविद्यालयहेडलबर्ग विश्वविद्यालय श्रेणी:तन्त्रीय जीवविज्ञान