ओपन एम एम

OpenMM <!- Peter Eastman is primary author. For developers, listing institutions that host the labs developing OpenMM. -> Peter Eastman Stanford University Memorial Sloan Kettering Cancer CenterPompeu Fabra UniversityNational Heart, Lung, and Blood Institute January 20, 2010SimTK: OpenMM: Downloads SimTK 2020-12-10 https://simtk.org/frs/?group_id=161 2022-09-09 8.2.0 2024 11 08 yesRelease OpenMM 8.2.0 · openmm/openmm GitHub 2024-11-08 https://github.com/openmm/openmm/releases/tag/8.2.0 2025-02-27 C++, C, CUDA, Python Linux, macOS, Windows Many English Molecular dynamics MIT LicenseLGPL https://openmm.org/ओपनएमएम विभिन्न प्रकार के हार्डवेयर आर्किटेक्चर पर आणविक गतिकी अनुकरण करने के लिए एक पुस्तकालय है। पहली बार जनवरी 2010 में जारी किया गया, इसे पीटर ईस्टमैन द्वारा स्टैनफोर्ड विश्वविद्यालय में विविजय एस. पांडे प्रयोगशाला में लिखा गया था।https://simtk.org/frs/?group_id=161 SimTK: OpenMM: Downloads 2020-12-10 SimTK 2022-09-09 यह Folding@home परियोजना के कोर 22 कर्नेल में इसके कार्यान्वयन के लिए उल्लेखनीय है। कोर22, जिसे पांडे प्रयोगशाला में भी विकसित किया गया है, सीयूडीए और ओपनसीएल के माध्यम से जीपीयू पर प्रोटीन डायनामिक्स सिमुलेशन करने के लिए ओपनएमएम का उपयोग करता है। COVID-19 महामारी के दौरान, 280,000 GPU के शिखर को कोर 22 के माध्यम से ओपनएमएम चलाने का अनुमान था।Zimmerman Maxwell I. Porter Justin R. Ward Michael D. Singh Sukrit Vithani Neha Meller Artur Mallimadugula Upasana L. Kuhn Catherine E. Borowsky Jonathan H. 2021-05-24 SARS-CoV-2 simulations go exascale to predict dramatic spike opening and cryptic pockets across the proteome Nature Chemistry Springer Science and Business Media LLC 13 7 651–659 2021NatCh..13..651Z 10.1038/s41557-021-00707-0 1755-4330 8249329 34031561 free फीचर्स ओपनएमएम में सी + + एपीआई के साथ-साथ पायथन रैपर भी है। डेवलपर्स निम्न-स्तरीय सिमुलेशन नियंत्रण के लिए बल क्षेत्र के साथ-साथ इंटीग्रेटर्स को अनुकूलित करने में सक्षम हैं। जिन उपयोगकर्ताओं को केवल अपने सिमुलेशन के उच्च-स्तरीय नियंत्रण की आवश्यकता होती है, वे अंतर्निहित बल क्षेत्रों (कई सामान्य रूप से उपयोग किए जाने वाले बल क्षेत्रों से मिलकर) और लैंगविन, वेरलेट, नोस-हूवर और ब्राउनियन जैसे इंटीग्रेटर्स में निर्मित) का उपयोग कर सकते हैं। यह भी देखें Free and open-source software ग्रोमैक्स चार्म नाम्ड एम्बर बल-क्षेत्र कार्यान्वयनों की तुलना ग्रेस (प्लॉटिंग उपकरण) फोल्डिंग@होम आणविक यांत्रिकी मॉडलिंग हेतु सॉफ़्टवेयरों की तुलना आणविक डिज़ाइन सॉफ़्टवेयर बेनेट स्वीकृति अनुपात लैम्प्स संदर्भ 2 “SimTK: OpenMM: डाउनलोड्स”. SimTK. 10-12-2020. 09-09-2022 को प्राप्त किया गया। “OpenMM 8.2.0 जारी किया गया · openmm/openmm”. GitHub. 08-11-2024. 27-02-2025 को प्राप्त किया गया। ज़िम्मरमैन, मैक्सवेल आई.; पोर्टर, जस्टिन आर.; वार्ड, माइकल डी.; सिंह, सुकृत; विथानी, नेहा; मेलर, आर्तुर; मल्लिमाडुगुला, उपासना एल.; कुहन, कैथरीन ई.; बोरोव्स्की, जोनाथन एच.; विवियोरा, राफाल पी.; हर्ले, मैथ्यू एफ. डी.; हार्बिसन, ऐओफ़ एम.; फोगार्टी, कार्ल ए.; कॉफलैंड, जोसेफ ई.; फड्डा, एलिसा; वोल्ज़, विन्सेंट ए.; चोडेरा, जॉन डी.; बोमन, ग्रेगरी आर. (24-05-2021). “SARS-CoV-2 सिमुलेशन एक्सास्केल स्तर तक पहुँचकर स्पाइक के नाटकीय खुलने तथा पूरे प्रोटीओम में छिपी हुई जेबों की भविष्यवाणी करते हैं”. नेचर केमिस्ट्री. 13 (7). स्प्रिंगर साइंस एंड बिज़नेस मीडिया एलएलसी: 651–659।