लैम्प्स

अंग्रेजी जून 2026 Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator Lammps-logo.png Steve Plimpton, Aidan Thompson, Stan Moore, Axel Kohlmeyer, Richard Berger Sandia National LaboratoriesTemple University 1995 property preferred edit@end reference P348 Q2804309 qualifier P348 Q2804309 P577 C++ Cross-platform: Linux, macOS, Windows, FreeBSD, Solaris x86, x86-64, ARM, POWER9 534 MB English Molecular dynamics GNU General Public License लैम्प्स (बड़े पैमाने पर परमाणु/आणविक बड़े पैमाने पर समानांतर सिम्युलेटर) सैंडिया नेशनल लेबोरेटरीज द्वारा विकसित एक आणविक गतिकी कार्यक्रम है।https://www.lammps.org/ LAMMPS Molecular Dynamics Simulator Sandia National Laboratories 2022-07-13 यह समानांतर संचार के लिए संदेश पारित करने वाले इंटरफेस (एमपीआई) का उपयोग करता है, जिससे उच्च प्रदर्शन वाले अनुकरण को सक्षम किया जा सकता है। लैम्प्स एक मुक्त और मुक्त स्रोत सॉफ्टवेयर है, जिसे जीएनयू जनरल पब्लिक लाइसेंस की शर्तों के तहत वितरित किया गया है। यह लिनक्स, विंडोज और मैकओएस प्लेटफार्मों पर उपलब्ध है। इतिहास. लैम्प्स को 1990 के दशक के मध्य में संयुक्त राज्य अमेरिका के ऊर्जा विभाग (सैंडिया नेशनल लेबोरेटरीज और लॉरेंस लिवरमोर नेशनल लेबोरेटरी) और तीन कंपनियों (क्रे, ड्यूपॉन्ट और ब्रिस्टल-मायर्स स्क्विब) की दो प्रयोगशालाओं के बीच एक सहकारी अनुसंधान और विकास समझौते के तहत विकसित किया गया था।Thompson Aidan P. Aktulga H. Metin Berger Richard Bolintineanu Dan S. Brown W. Michael Crozier Paul S. In 't Veld Pieter J. Kohlmeyer Axel Moore Stan G. 4 2022 LAMMPS-a flexible simulation tool for particle-based materials modeling at the atomic, meso, and continuum scales Computer Physics Communications 271 2022CoPhC.27108171T 10.1016/j.cpc.2021.108171 free free लक्ष्य एक समानांतर आणविक गतिकी कोड बनाना था जो सामग्री और जैव आणविक मॉडलिंग के लिए बड़े सुपरकंप्यूटर पर चलने में सक्षम था।Plimpton S. 1993-05-01 Fast parallel algorithms for short-range molecular dynamics https://digital.library.unt.edu/ark:/67531/metadc1389173/ Journal of Computational Physics 117 1 1–19 10.2172/10176421 10176421 प्रारंभ में फोरट्रान में लिखा गया, लैम्प्स को सी + + में फिर से लिखा गया है ताकि नई सुविधाओं को जोड़ने में अधिक लचीलापन और आसानी प्रदान की जा सके। फीचर्स एलएएमएमपीएस एक अत्यधिक लचीला और स्केलेबल आणविक गतिकी सिम्युलेटर है जो एमपीआई और ओपनएमपी के माध्यम से एकल-प्रोसेसर और समानांतर निष्पादन दोनों का समर्थन करता है। इसमें GPU एक्सेलेरेशन भी दिया गया है। एलएएमएमपीएस को एक इनपुट स्क्रिप्ट के साथ-साथ एक ग्राफिकल इंटरफेस जीयूआई से चलाया जा सकता है।Gravelle Simon Gissinger Jacob R. Kohlmeyer Axel 2025 A Set of Tutorials for the LAMMPS Simulation Package [Article v1.0] Living Journal of Computational Molecular Science 6 3027 2503.14020 10.33011/livecoms.6.1.3037 इसके मॉड्यूलर, ओपन-सोर्स सी + + डिज़ाइन को पायथन जैसे अन्य कोड या भाषाओं के साथ विस्तारित या एकीकृत करना आसान है। उपयोगकर्ता चर को परिभाषित कर सकते हैं, लूप का उपयोग कर सकते हैं और एक ही स्क्रिप्ट से एक साथ कई सिमुलेशन चला सकते हैं।https://docs.lammps.org/Intro_features.html General features — LAMMPS documentation LAMMPS 11 April 2025 कण और मॉडल प्रकार एल. ए. एम. एम. पी. एस. साधारण परमाणुओं से लेकर अणु, धातु और दानेदार सामग्री जैसी जटिल प्रणालियों तक विभिन्न प्रकार के कणों और मॉडल प्रकारों का समर्थन करता है। यह परिमित आकार के आकारों को भी संभालता है, जैसे कि गोलाकार और दीर्घवृत्ताकार कण, बिंदु द्विध्रुवीय कण, और चुंबकीय स्पिन, और इन कणों और मॉडल प्रकारों के संकर संयोजनों का उपयोग करने की संभावना प्रदान करता है।Coupled Magnetic Spin Dynamics and Molecular Dynamics in a Massively Parallel Framework (LDRD Final Report) Albuquerque, NM, United Stateshttps://docs.lammps.org/Intro_features.html General features — LAMMPS documentation LAMMPS 11 April 2025"General features — LAMMPS documentation". अंतरपरमाण्विक क्षमताएँ एलएएमएमपीएस क्षमताओं की एक विशाल सरणी का समर्थन करता है, जिसमें युग्म (जैसे, लेनार्ड-जोन्स, कूलम्बिक) कई-शरीर (जैसे, ईएएम, आरईबीओ, रीएक्सएफएफ) मशीन लर्निंग (जैसे, एसीई, जीएपी) और विशेष मॉडल (जैसे, टीआईपी 4 पी वाटर) शामिल हैं।Aktulga H.M. Fogarty J.C. Pandit S.A. Grama A.Y. 2012 Parallel reactive molecular dynamics: Numerical methods and algorithmic techniques Parallel Computing Elsevier 38 4–5 245–259 10.1016/j.parco.2011.08.005 यह संकर और आच्छादित क्षमताओं को भी समायोजित करता है, जिससे एक ही अनुकरण में कई संभावित प्रकारों के संयोजन को सक्षम किया जा सकता है। समूह, बाधाएं और सीमा शर्तें एलएएमएमपीएस ऑर्थोगोनल या गैर-ऑर्थोगोनल (ट्राइक्लिनिक) सिमुलेशन डोमेन के साथ 2डी और 3डी दोनों प्रणालियों का समर्थन करता है। इसमें कई थर्मोस्टेट और बारोस्टेट विकल्प शामिल हैं, जैसे कि नाक/हूवर, बेरेन्डसन और पैरिनेलो/रहमान। विभिन्न कठोर शरीर की बाधाओं और उन्नत एल्गोरिदम जैसे शेक और रैटल को अतिरिक्त हार्मोनिक बलों के साथ जोड़ा जा सकता है। इसके अतिरिक्त, एलएएमएमपीएस कुछ मोंटे कार्लो चाल, परमाणु और अणु सम्मिलन और विलोपन, गैर-संतुलन आणविक गतिकी (एनईएमडी) और विभिन्न प्रकार की सीमा स्थितियों (जैसे, आवधिक, सिकुड़न-लिपटे हुए) और दीवारों (स्थिर और गतिशील) का समर्थन करता है।Thompson Aidan P. Aktulga H. Metin Berger Richard Bolintineanu Dan S. Brown W. Michael Crozier Paul S. In 't Veld Pieter J. Kohlmeyer Axel Moore Stan G. 4 2022 LAMMPS-a flexible simulation tool for particle-based materials modeling at the atomic, meso, and continuum scales Computer Physics Communications 271 2022CoPhC.27108171T 10.1016/j.cpc.2021.108171 free freeThompson, Aidan P.; Aktulga, H. Metin; Berger, Richard; Bolintineanu, Dan S.; et al. (2022). समाकलक एल. ए. एम. एम. पी. एस. के साथ कई समाकलकों का उपयोग किया जा सकता है, जिसमें वेग-वर्लेट समाकलक, ब्राउनियन गतिकी और कठोर शरीर समाकलन शामिल हैं। यह संयुग्म प्रवणता, सबसे अधिक अवरोहण और नम गतिकी (एफ. आई. आर. ई., क्विकमिन) के साथ-साथ आर. आर. इ. एस. पी. ए. पदानुक्रमित समय निर्धारण और निश्चित या अनुकूली समय चरणों जैसी ऊर्जा लघुकरण तकनीकों का भी समर्थन करता है। इसके अतिरिक्त, पुनः चलाने का आदेश डंप फ़ाइलों के पोस्ट-प्रोसेसिंग की अनुमति देता है।https://docs.lammps.org/Intro_features.html General features — LAMMPS documentation LAMMPS 11 April 2025"General features — LAMMPS documentation". आउटपुट एलएएमएमपीएस प्रणाली गुणों की निगरानी के लिए कई फिक्स और गणना आदेश प्रदान करता है। ऊष्मागतिकीय डेटा, जैसे कि प्रणाली का तापमान और ऊर्जा, लॉग किया जाता है, और परमाणु-स्तर की जानकारी जैसे कि स्थिति और वेग चुने हुए अंतराल पर पाठ या द्विआधारी डंप फ़ाइलों के माध्यम से आउटपुट हो सकते हैं। एलएएमएमपीएस आउटपुट को स्थानिक या अस्थायी संकल्प के लिए अंशों, समय औसत या हिस्टोग्रामिंग का उपयोग करके अनुकूलित करने की भी अनुमति देता है। अनुकरण की स्थिति को पाठ और द्विआधारी पुनरारंभ फ़ाइलों में सहेजा जा सकता है। इसके अतिरिक्त, एलएएमएमपीएस विभिन्न प्रारूपों में परमाणु स्नैपशॉट निर्यात कर सकता है।https://docs.lammps.org/Intro_features.html General features — LAMMPS documentation LAMMPS 11 April 2025"General features — LAMMPS documentation". Gravelle Simon Gissinger Jacob R. Kohlmeyer Axel 2025 A Set of Tutorials for the LAMMPS Simulation Package [Article v1.0] Living Journal of Computational Molecular Science 6 3027 2503.14020 10.33011/livecoms.6.1.3037Gravelle, Simon; Gissinger, Jacob R.; Kohlmeyer, Axel (2025). तरह-तरह के संगणकीय दक्षताक लेल, एलएएमएमपीएस लगक कणसभक निगरानी करबाक लेल पड़ोसी सूची (वर्लेट सूची) क उपयोग करैत अछि। सूचियों को उन कणों के साथ प्रणालियों के लिए अनुकूलित किया जाता है जो कम दूरी पर पीछे हटते हैं, ताकि कणों का स्थानीय घनत्व कभी भी बहुत बड़ा न हो।Plimpton S. 1993-05-01 Fast parallel algorithms for short-range molecular dynamics https://digital.library.unt.edu/ark:/67531/metadc1389173/ Journal of Computational Physics 117 1 1–19 10.2172/10176421 10176421Plimpton, S. (1993-05-01). समानांतर कंप्यूटरों पर, एलएएमएमपीएस सिमुलेशन डोमेन को छोटे 3डी उप-डोमेन में विभाजित करने के लिए स्थानिक-अपघटन तकनीकों का उपयोग करता है, जिनमें से एक प्रत्येक प्रोसेसर को सौंपा जाता है। प्रोसेसर परमाणुओं के लिए भूत परमाणु जानकारी का संचार और भंडारण करते हैं जो उनके उपक्षेत्र की सीमा पर होते हैं। एल. ए. एम. एम. पी. एस. सबसे कुशल है (एक समानांतर कंप्यूटिंग अर्थ में उन प्रणालियों के लिए जिनके कण लगभग समान घनत्व के साथ एक 3डी आयताकार बॉक्स को भरते हैं। बहुत सारे त्वरक एलएएमएमपीएस द्वारा समर्थित हैं, जिसमें जीपीयू (सीयूडीए, ओपनसीएल, एचआईपी, एसवाईसीएल इंटेल ज़ीओन फाई और ओपनएमपी शामिल हैं, ट्रिलीनोस के साथ इसके एकीकरण के कारण। लैम्प्स को अन्य सॉफ्टवेयर के साथ जोड़ना लैम्प्स को विभिन्न प्रकार के बाहरी विश्लेषण उपकरणों और विज़ुअलाइज़ेशन इंजनों के साथ जोड़ा जा सकता है, जिसमें वीएमडी और ओविटो शामिल हैं।https://www.lammps.org/external.html External Coupling and Integration LAMMPS Official Website 2025-04-12Humphrey William Dalke Andrew Schulten Klaus 1996 VMD: Visual Molecular Dynamics Journal of Molecular Graphics Elsevier 14 1 33–38 10.1016/0263-7855(96)00018-5 8744570Stukowski Alexander 2009-12-15 Visualization and analysis of atomistic simulation data with OVITO–the Open Visualization Tool Modelling and Simulation in Materials Science and Engineering 18 1 10.1088/0965-0393/18/1/015012 42073422 एलएएमएमपीएस को पायथन पुस्तकालयों के साथ जोड़ा जा सकता है ताकि एमडीए एनालिसिस, एमडीट्राज, और एएसई जैसे सिमुलेशन की स्थापना और विश्लेषण किया जा सके।Naughton Fiona B Alibay Irfan Barnoud Jonathan Barreto-Ojeda Estefania Beckstein Oliver Bouysset Cédric Cohen Orion Gowers Richard J MacDermott-Opeskin Hugo 4 2022 MDAnalysis 2.0 and beyond: fast and interoperable, community driven simulation analysis Biophysical Journal Elsevier 121 3 272a–273a 2022BpJ...121..272N 10.1016/j.bpj.2021.11.1368McGibbon Robert T Beauchamp Kyle A Schwantes Christian R Wang Lee-Ping Hernández Carlos X Harrigan Matthew P Lane Thomas J Swails Jason M Pande Vijay S 4 2014-09-09 MDTraj: a modern, open library for the analysis of molecular dynamics trajectories Biophysical Journal 109 8 1528–1532 10.1016/j.bpj.2015.08.015 4623899 26488642Hjorth Larsen Ask Mortensen Jens Jørgen Blomqvist Jakob Castelli Ivano E. Christensen Rune Dynesen Mathias Groves Michael N. Haastrup Sten Jensen Per B. 4 2017 The Atomic Simulation Environment—a Python library for working with atoms Journal of Physics: Condensed Matter 29 27 273002 2017JPCM...29A3002H 10.1088/1361-648X/aa680e 28323250 free इसके अलावा, लैम्प्स मुफ्त ऊर्जा गणना उपकरणों जैसे कि प्लमड और कोल्वार्स मॉड्यूल के साथ युग्मन का समर्थन करता है।Tribello Gareth A. Bonomi Massimiliano Branduardi Davide Camilloni Carlo Bussi Giovanni 2014-02-01 PLUMED 2: New feathers for an old bird https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0010465513003196 Computer Physics Communications 185 2 604–613 1310.0980 2014CoPhC.185..604T 10.1016/j.cpc.2013.09.018 0010-4655 17904052Fiorin Giacomo Klein Michael L. Hénin Jérôme December 2013 Using collective variables to drive molecular dynamics simulations Molecular Physics 111 22–23 3345–3362 2013MolPh.111.3345F 10.1080/00268976.2013.813594 0026-8976 यह भी देखें समानांतर संगणना आणविक यांत्रिकी मॉडलिंग के लिए सॉफ्टवेयर की तुलना आणविक डिजाइन सॉफ्टवेयर मुक्त और मुक्त स्रोत सॉफ्टवेयर पैकेजों की सूची संदर्भ “स्थिर रिलीज़ 22 जुलाई 2025”. 22 जुलाई 2025. 6 जनवरी 2026 को प्राप्त किया गया। “LAMMPS आणविक गतिकी सिम्युलेटर”. सैंडिया नेशनल लेबोरेट्रीज़. 13-07-2022 को प्राप्त किया गया। थॉम्पसन, एडन पी.; अक्टुल्गा, एच. मेटिन; बर्जर, रिचर्ड; बोलिन्टिनियानु, डैन एस.; एवं अन्य (2022). “LAMMPS — परमाण्विक, मेसो तथा सतत पैमानों पर कण-आधारित पदार्थ मॉडलिंग के लिए एक लचीला सिमुलेशन उपकरण”. कंप्यूटर फिजिक्स कम्युनिकेशंस. 271: 108171। प्लिम्पटन, एस. (01-05-1993). “लघु-दूरी आणविक गतिकी हेतु तीव्र समानांतर एल्गोरिथ्म”. जर्नल ऑफ कम्प्यूटेशनल फिजिक्स. 117 (1): 1–19। ग्रावेल, साइमन; गिसिंगर, जैकब आर.; कोलमायर, एक्सेल (2025). “LAMMPS सिमुलेशन पैकेज हेतु ट्यूटोरियल्स का एक समूह [लेख v1.0]”. लिविंग जर्नल ऑफ कम्प्यूटेशनल मॉलिक्यूलर साइंस. 6: 3027। “सामान्य विशेषताएँ — LAMMPS प्रलेखन”. LAMMPS. 11 अप्रैल 2025 को प्राप्त किया गया। ट्रैंचिडा, जूलियन; वुड, मिशेल; मूर, स्टैन (01-09-2018). विशाल समानांतर ढाँचे में युग्मित चुंबकीय स्पिन गतिकी और आणविक गतिकी (अंतिम रिपोर्ट)। अल्बुकर्क, न्यू मैक्सिको, संयुक्त राज्य अमेरिका: सैंडिया नेशनल लैबोरेटरी। अक्टुल्गा, एच.एम.; फोगार्टी, जे.सी.; पंडित, एस.ए.; ग्रामा, ए.वाई. (2012). “समानांतर प्रतिक्रियाशील आणविक गतिकी: संख्यात्मक विधियाँ और एल्गोरिथ्मिक तकनीकें”. पैरेलल कंप्यूटिंग. 38 (4–5): 245–259। “बाह्य युग्मन और एकीकरण”. LAMMPS आधिकारिक वेबसाइट. 12-04-2025 को प्राप्त किया गया। हम्फ्री, विलियम; डाल्के, एंड्रयू; शुल्टेन, क्लाउस (1996). “VMD: दृश्य आणविक गतिकी”. जर्नल ऑफ मॉलिक्यूलर ग्राफिक्स. 14 (1): 33–38। स्टुकोव्स्की, अलेक्ज़ेंडर (15-12-2009). “OVITO — ओपन विज़ुअलाइज़ेशन टूल के साथ परमाण्विक सिमुलेशन डेटा का दृश्यांकन और विश्लेषण”. मॉडलिंग एंड सिमुलेशन इन मैटेरियल्स साइंस एंड इंजीनियरिंग. 18 (1): 015012। नॉटन, फियोना बी.; अलीबे, इरफान; बार्नूड, जोनाथन; बैरेटो-ओहेडा, एस्टेफानिया; एवं अन्य (2022). “MDAnalysis 2.0 और आगे: तीव्र, पारस्परिक-संगत तथा समुदाय-प्रेरित सिमुलेशन विश्लेषण”. बायोफिजिकल जर्नल. 121 (3): 272a–273a। मैकगिबन, रॉबर्ट टी.; ब्यूचैम्प, काइल ए.; श्वांटेस, क्रिश्चियन आर.; वांग, ली-पिंग; एवं अन्य (09-09-2014). “MDTraj: आणविक गतिकी प्रक्षेपपथों के विश्लेषण हेतु एक आधुनिक मुक्त पुस्तकालय”. बायोफिजिकल जर्नल. 109 (8): 1528–1532। ह्योर्थ लार्सन, आस्क; मोर्टेंसन, जेन्स योर्गेन; ब्लोमक्विस्ट, जैकब; कास्टेली, इवानो ई.; एवं अन्य (2017). “Atomic Simulation Environment — परमाणुओं के साथ कार्य करने हेतु एक पाइथन पुस्तकालय”. जर्नल ऑफ फिजिक्स: कंडेन्स्ड मैटर. 29 (27): 273002। ट्रिबेलो, गैरेथ ए.; बोनोमी, मासिमिलियानो; ब्रांडुआर्डी, डेविड; कैमिलोनी, कार्लो; बुसी, जियोवानी (01-02-2014). “PLUMED 2: पुराने पक्षी के लिए नए पंख”. कंप्यूटर फिजिक्स कम्युनिकेशंस. 185 (2): 604–613। फियोरिन, जियाकोमो; क्लाइन, माइकल एल.; हेनिन, जेरोम (दिसंबर 2013). “आणविक गतिकी सिमुलेशन को संचालित करने हेतु सामूहिक चर का उपयोग”. मॉलिक्यूलर फिजिक्स. 111 (22–23): 3345–3362। बाहरी लिंक Free and open-source software